در این انیمه انسان های به خاطر افزایش گرمای زمین در قرن ۲۱ بیشتر مناطق مسکونی برای زندگی رو از دست داده یه سری اسکادران فضایی با اسلحه هایی خیلی بزرگ روی زمین فرود میان و چون انسان ها توانایی مقابله با اونها رو نداشتن شکست خوردن و دیگه نمی تونستن از طریق دریاها مسافرت بکنن . ۱۷ سال بعد یک جنگ عظیم دریای شکل میگیره گانزو چیهایا ( Gunzou Chihaya ) و دوستانش یه طوری موفق میشن که یه زیردریایی از نیروهای دشمن رو بدست بیارن و اسم اون زیردریایی رو به I – 401 تغییر میدن و شروع به مبارزه با این موجودات فضایی میکنن.