شینیچی کودو, یک دانش آموز دبیرستانی است که استعداد حیرت انگیزی در کاراگاه بودن داره, بدلیل اینکه او چندین مورد چالش برانگیز رو توانسه حل و راز گشایی کنه. یک روز, هنگامی که شینیچی بعد از ملاقات با معشوقه ی خود, نا خواسته شاهد یک معامله غیرقانونی قرار می گیره. شینیچی توسط معامله کننده ها دستگیر میشه, آنها به او داروی آزمایشی که توسط سازمان جنایی آنها تهیه شده را به او تزریق میکنن تا او کشته بشه, اما شینیچی بیدار میشه و خودش رو یک پسر بچه هفت ساله مشاهده می کنه, برای اینکه کسی که باهاش این کار رو کرده پیدا و دستگیر کنه هویت خودش رو مخفی میکنه و…